美国波士顿当地时间10月30日-11月3日,在海因斯会议中心举办的iGEM(International Genetically Engineered Machine Competition)国际基因机器设计大赛全球总决赛中,上海交通大学iGEM软件队(SJTU-Software)团队成功斩获一枚金牌。
“Easy BBK” —— 一款以生物积块为核心的实用软件包
SJTU-Software团队的参赛项目名为“Easy BBK——An Easy Biobrick Blueprint's Package”,即整合了生物积块搜索引擎、画图以及上传工具的软件。团队重新搭建起生物积块的数据库,在官方提供的数据源的基础上,加入生物积块更多的信息以衡量每一个生物积块在实验中的可靠程度,使得搜索引擎显示的结果能够按用户需求或生物积块的质量排序。团队设计的生物积块画图工具,不仅仅能够将以前实验队的生物积块展示图全部统一起来,未来还能够让实验队都统一的使用团队的软件进行作图。同时,为了方便用户上传新设计的生物积块信息到官方数据库,团队设计的上传工具可以直接通过在画图时将每个子生物积块的信息与数据库相连,使得上传生物积块的信息变得更简单高效。
“Easy BBK”将几个实用功能整合到一起,给用户一种非常完整的体验。来自多个大学的团队在使用完之后,都对该软件产生了极大的兴趣,希望能继续深入开发。
SJTU-Software团队的成功源自多方支持
SJTU-Software团队组建于2014年4月,由我院、电子信息与电气工程学院、生物医学工程学院、媒体与设计学院的10名本科学生组成。团队在组建和参赛的过程中,得到校团委、我院、电子信息与电气工程学院的大力支持,由我院陈峰、韦朝春和欧竑宇三位老师共同担任指导老师。
自2014年4月开始,团队进入选题阶段,队员们利用课余时间进行了多次“头脑风暴”,不断提出新的想法和思路,分析对比可行性和创新性,最终确定了参赛项目。随后队员们明确分工后,开始进行软件前台和后台的设计和测试,在图书馆自习室、我院会议室,每天都能看到队员们忙碌而又快乐的身影。
iGEM承载着大家在交大美好的记忆,记录着团队成长的故事。学校的支持、老师的指导、队员们的互勉是团队不断前进的动力。
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iGEM(International Genetically Engineered Machine Competition)国际基因机器设计大赛是美国麻省理工学院(MIT)于2004年发起的一个大学生层面的有关合成生物学的竞赛活动,发展至今已成为世界上最前沿和最具影响力的生物学竞赛,堪称生物学界未来精英的聚会和头脑风暴式的科学盛宴。今年的大赛规模更是空前巨大,包括哈佛、耶鲁、加州理工、麻省理工、剑桥、牛津、上海交大、北大、清华、复旦、中国科大、浙大等多所世界知名高校派队参赛,参赛队伍多达245支。
该项赛事学术价值极高,每年均有参赛项目被Science、Nature等顶级期刊收录。此外,iGEM的比赛内容还包括各种各样的非实验任务,例如设计介绍项目的海报、开展以推广合成生物学为目的的社会活动等,对参赛者的综合能力要求非常高。